Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gtf3c6Q9D8P7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gtf3c6Q9D8P7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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