Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl4Q9D8E6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms