Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp4bQ9D8B3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms