Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fip1l1Q9D824 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms