Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rep15Q9D7T1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rep15Q9D7T1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rep15Q9D7T1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rep15Q9D7T1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rep15Q9D7T1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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