Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl40Q9D783 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms