Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gbe1Q9D6Y9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms