Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Borcs6Q9D6W8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Borcs6Q9D6W8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms