Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc94Q9D6J3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc94Q9D6J3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms