Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a3Q9D554 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms