Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Phf6Q9D4J7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms