Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lonrf3Q9D4H7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lonrf3Q9D4H7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms