Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D5

4933414I15Rik, RIKEN cDNA 4933414I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933414I15RikQ9D4D5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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4933414I15RikQ9D4D5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
4933414I15RikQ9D4D5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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4933414I15RikQ9D4D5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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4933414I15RikQ9D4D5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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4933414I15RikQ9D4D5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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4933414I15RikQ9D4D5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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4933414I15RikQ9D4D5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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4933414I15RikQ9D4D5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4933414I15RikQ9D4D5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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4933414I15RikQ9D4D5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
4933414I15RikQ9D4D5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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4933414I15RikQ9D4D5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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4933414I15RikQ9D4D5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4933414I15RikQ9D4D5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4933414I15RikQ9D4D5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
4933414I15RikQ9D4D5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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