Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sgms2Q9D4B1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sgms2Q9D4B1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms