Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gpn3Q9D3W4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpn3Q9D3W4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms