Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3G5

Stx11, Syntaxin-11, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx11Q9D3G5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx11Q9D3G5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx11Q9D3G5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms