Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rufy3Q9D394 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rufy3Q9D394 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms