Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D2Q3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D2Q3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms