Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pramef12Q9D2F1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms