Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Spns3Q9D232 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms