Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syf2Q9D198 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Syf2Q9D198 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms