Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Hddc3Q9D114 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Hddc3Q9D114 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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Hddc3Q9D114 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms