Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpsap1Q9D0M1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpsap1Q9D0M1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms