Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exosc7Q9D0M0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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