Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Mms19Q9D071 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mms19Q9D071 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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