Protein–RNA interactions for Protein: Q9D035

Nkain1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain1Q9D035 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nkain1Q9D035 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Nkain1Q9D035 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Nkain1Q9D035 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Nkain1Q9D035 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nkain1Q9D035 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Nkain1Q9D035 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Nkain1Q9D035 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nkain1Q9D035 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkain1Q9D035 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkain1Q9D035 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkain1Q9D035 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkain1Q9D035 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nkain1Q9D035 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nkain1Q9D035 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkain1Q9D035 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nkain1Q9D035 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nkain1Q9D035 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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