Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf146Q9CZW6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf146Q9CZW6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf146Q9CZW6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf146Q9CZW6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rnf146Q9CZW6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rnf146Q9CZW6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rnf146Q9CZW6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rnf146Q9CZW6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rnf146Q9CZW6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rnf146Q9CZW6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rnf146Q9CZW6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rnf146Q9CZW6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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