Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shmt2Q9CZN7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms