Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nde1Q9CZA6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms