Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ04

Cops7a, COP9 signalosome complex subunit 7a, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7aQ9CZ04 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cops7aQ9CZ04 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms