Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rpl11Q9CXW4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms