Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmed5Q9CXE7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmed5Q9CXE7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms