Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Khdc3Q9CWU5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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