Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CWU4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CWU4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms