Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnot11Q9CWN7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot11Q9CWN7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms