Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx2Q9CWK8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms