Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVR1

Gm26657, Predicted gene, 26657 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26657Q9CVR1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26657Q9CVR1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26657Q9CVR1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26657Q9CVR1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26657Q9CVR1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26657Q9CVR1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26657Q9CVR1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26657Q9CVR1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26657Q9CVR1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26657Q9CVR1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26657Q9CVR1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26657Q9CVR1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26657Q9CVR1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26657Q9CVR1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26657Q9CVR1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26657Q9CVR1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm26657Q9CVR1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm26657Q9CVR1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm26657Q9CVR1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm26657Q9CVR1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm26657Q9CVR1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms