Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sppl3Q9CUS9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms