Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
4930535I16RikQ9CUI2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms