Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a2Q9CTG6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms