Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rprd1bQ9CSU0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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