Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp5f1Q9CQQ7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms