Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Med4Q9CQA5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Med4Q9CQA5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms