Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Trappc5Q9CQA1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc5Q9CQA1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms