Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp2Q9CQ73 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp2Q9CQ73 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms