Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpa3Q9CQ71 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms