Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms