Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Med21Q9CQ39 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Med21Q9CQ39 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Med21Q9CQ39 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Med21Q9CQ39 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Med21Q9CQ39 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med21Q9CQ39 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Med21Q9CQ39 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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