Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ssxb1Q9CPU1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ssxb1Q9CPU1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ssxb1Q9CPU1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ssxb1Q9CPU1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ssxb1Q9CPU1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ssxb1Q9CPU1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ssxb1Q9CPU1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ssxb1Q9CPU1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ssxb1Q9CPU1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ssxb1Q9CPU1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ssxb1Q9CPU1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ssxb1Q9CPU1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb1Q9CPU1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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