Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nsmce3Q9CPR8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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